Con ffmpeg es muy sencillo ponerle una marca de agua (o 2) a un vídeo. Lo podemos hacer con una imagen transparente que contenga la marca que queramos añadir usando el filtro overlay de ffmpeg de la siguiente manera:
ffmpeg -i "VÍDEO" -strict -2 -vf "movie=IMAGEN_CON_MARCA [watermark]; \ [in][watermark] overlay=main_w/2-overlay_w/2:main_h/2-overlay_h/2 [out]" \ -r 25 -b:a 128k -b:v 1200k "VÍDEO_CON_MARCA"
Solo debemos fijarnos en un detalle más: los argumentos referentes a los frames por segundo y el ratio de bits por segundo de audio y vídeo (opciones -r, -b:a y b:v, respectivamente). Poned los que os interese teniendo en cuenta el consumo de recursos.
Así podemos automatizar fácilmente este proceso y “marcar” un montón de vídeos:
for video in /videos_a_marcar do nombre="`basename $video | cut -d'.' -f1`" tipo="`basename $video | cut -d'.' -f2`" ffmpeg -i $video -strict -2 -vf "movie=IMAGEN_CON_MARCA [watermark]; \ [in][watermark] overlay=main_w/2-overlay_w/2:main_h/2-overlay_h/2 [out]" \ -r 25 -b:a 128k -b:v 1200k "$nombre-CON-MARCA-$tipo" done
¡Espero que os sea útil!
Referencias
PS: En la ayuda de ffmpeg se explica todos los argumentos, sobre todo en la referencia 1
PS: En el script falta comprobar posibles errores (que podemos leer y escribir, por ejemplo)